蛋白質(zhì)表達(dá)、分離、純化可以:(1)探索和研究基因的功能以及基因表達(dá)調(diào)控的機(jī)理;(2)供作結(jié)構(gòu)與功能的研究;(3)作為催化劑、營(yíng)養(yǎng)劑等。
實(shí)驗(yàn)原理:
攜帶有目標(biāo)蛋白基因的質(zhì)粒在大腸桿菌BL21中,在 37℃,IPTG誘導(dǎo)下,超量表達(dá)攜帶有6個(gè)連續(xù)組氨酸殘基的重組氯霉素酰基轉(zhuǎn)移酶蛋白,該蛋白可用一種通過共價(jià)偶連的次氨基三乙酸(NTA)使鎳離子(Ni
2+)固相化的層析介質(zhì)加以提純,實(shí)為金屬熬合親和層析(MCAC)。蛋白質(zhì)的純化程度可通過聚丙烯酰胺凝膠電泳進(jìn)行分析。
實(shí)驗(yàn)步驟:
一、試劑準(zhǔn)備
1. LB液體培養(yǎng)基:Trytone 10 g, yeast extract 5 g,NaCl 10 g,用蒸餾水配至1000 mL。
2. 氨芐青霉素:100 mg/mL。
3. 上樣緩沖液:100 mM NaH2PO4,10 mM Tris,8M Urea,10 mM 2-ME,pH8.0。
4. Washing Buffer:100 mM NaH2PO4,10 mM Tris,8 M Urea,pH6.3。
5. Elution Buffer:100 mM NaH2PO4,10 mMTris,8M Urea, 500 mM Imidazole, pH8.0。
6. IPTG:100mM IPTG(異丙基硫代-β-D-半乳糖苷):2.38g IPTG溶于100ml ddH2O中,0.22μm濾膜抽濾,-20℃保存。
二、獲得目的基因
1. 通過PCR方法:以含目的基因的克隆質(zhì)粒為模板,按基因序列設(shè)計(jì)一對(duì)引物(在上游和下游引物分別引入不同的酶切位點(diǎn)),PCR循環(huán)獲得所需基因片段。
2. 通過RT-PCR方法:用TRIzol法從細(xì)胞或組織中提取總RNA,以mRNA為模板,逆轉(zhuǎn)錄形成cDNA第一鏈,以逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為模板進(jìn)行PCR循環(huán)獲得產(chǎn)物。
三、構(gòu)建重組表達(dá)載體
1. 載體酶切:將表達(dá)質(zhì)粒用限制性內(nèi)切酶(同引物的酶切位點(diǎn))進(jìn)行雙酶切,酶切產(chǎn)物行瓊脂糖電泳后,用膠回收Kit或凍融法回收載體大片段。
2. PCR產(chǎn)物雙酶切后回收,在T4DNA連接酶作用下連接入載體。
四、獲得含重組表達(dá)質(zhì)粒的表達(dá)菌種
1. 將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,根據(jù)重組載體的標(biāo)志(抗Amp或藍(lán)白斑)作篩選,挑取單斑,堿裂解法小量抽提質(zhì)粒,雙酶切初步鑒定。
2. 測(cè)序驗(yàn)證目的基因的插入方向及閱讀框架均正確,進(jìn)入下步操作。否則應(yīng)篩選更多克隆,重復(fù)亞克隆或亞克隆至不同酶切位點(diǎn)。
3. 以此重組質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)化表達(dá)宿主菌的感受態(tài)細(xì)胞。
五、氯霉素酰基轉(zhuǎn)移酶重組蛋白的誘導(dǎo)
1. 接種含有重組氯霉素?;D(zhuǎn)移酶蛋白的大腸桿菌BL21菌株于5 mL LB液體培養(yǎng)基中(含100 ug/mL 氨芐青霉素),37℃震蕩培養(yǎng)過夜。
2. 按1∶50或1:100的比例稀釋過夜菌,一般轉(zhuǎn)接1 mL過夜培養(yǎng)物于100 mL(含100 ug/mL 氨芐青霉素)LB液體培養(yǎng)基中,37℃震蕩培養(yǎng)至OD600 = 0.6 - 0.8(最好0.6,大約需3 h)。取10 ul 樣品用于SDS-PAGE 分析。
3. 對(duì)照組不加誘導(dǎo)劑,實(shí)驗(yàn)組加入IPTG至終濃度0.5 mmol/l,37℃繼續(xù)培養(yǎng)1-3h。
4. 12 000 rpm 離心10 min,棄上清,菌體沉淀保存于-20℃或-70℃冰箱中。
六、氯霉素?;D(zhuǎn)移酶重組蛋白的分離、純化
1. NTA層析柱的準(zhǔn)備:在層析柱中加入1 mL NTA介質(zhì),并分別用8 mL 去離子水,8 mL上樣緩沖液洗滌。
2. 重組蛋白的變性裂解:在冰浴中凍融菌體沉淀,加入5 mL上樣緩沖液, 用吸管抽吸重懸,超聲波破裂菌體,用振蕩器等輕柔的混勻樣品60 min,4℃ 12000 rpm 離心 30 min,將上清吸至一個(gè)干凈的容器中,并棄沉淀。取10 ul 上清樣品用于SDS-PAGE 分析。
3. 上清樣品以10-15 mL/h 流速上Ni2+-NTA柱,收集流出液,取10 ul樣品用于SDS-PAGE 分析。
4. 洗脫雜蛋白:用Washing Buffer以10-15 mL/h流速洗柱,直至OD280 = 0.01分步收集洗脫液,約3-4 h,取10 ul洗脫開始時(shí)的樣品用于SDS-PAGE 分析。
5. 洗脫目標(biāo)蛋白:用Elution Buffer洗柱,收集每1 mL 級(jí)分,分別取10 ul樣品用于SDS-PAGE 分析。
注意事項(xiàng):
1. 選擇表達(dá)載體時(shí),要根據(jù)所表達(dá)蛋白的最終應(yīng)用考慮。如為方便純化,可選擇融合表達(dá);如為獲得天然蛋白,可選擇非融合表達(dá)。
2. 融合表達(dá)時(shí)在選擇外源DNA同載體分子連接反應(yīng)時(shí),對(duì)轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)譯過程中密碼結(jié)構(gòu)的閱讀不能發(fā)生干擾。
3. 菌液OD值要小于1,否則細(xì)胞太濃太老,不易破碎,且質(zhì)粒易丟失。
4. 誘導(dǎo)時(shí)間最好做一個(gè)梯度,不同蛋白誘導(dǎo)時(shí)間需摸索。
5. 誘導(dǎo)溫度適當(dāng)摸索:25、30℃。
6. IPTG濃度:一般在1 mM 以內(nèi),可適當(dāng)摸索。
7. 超聲條件可視實(shí)際情況改變,只要使菌體裂解充分即可,即菌液清亮不粘稠。
原核表達(dá)
1. 原核表達(dá)簡(jiǎn)介
將克隆化基因插入合適載體后導(dǎo)入大腸桿菌用于表達(dá)大量蛋白質(zhì)的方法一般稱為原核表達(dá)。這種方法在蛋白純化、定位及功能分析等方面都有應(yīng)用。
2. 大腸桿菌用于表達(dá)重組蛋白的特點(diǎn)
(1)易于生長(zhǎng)和控制;
(2)用于細(xì)菌培養(yǎng)的材料不及哺乳動(dòng)物細(xì)胞系統(tǒng)的材料昂貴;
(3)有各種各樣的大腸桿菌菌株及與之匹配的具各種特性的質(zhì)??晒┻x擇;
(4)在大腸桿菌中表達(dá)的蛋白由于缺少修飾和糖基化、磷酸化等翻譯后加工,常形成包涵體而影響表達(dá)蛋白的生物學(xué)活性及構(gòu)象。
3. 原核表達(dá)載體
通常為質(zhì)粒,典型的表達(dá)載體應(yīng)具有以下幾種元件:
(1)選擇標(biāo)志的編碼序列;
(2)可控轉(zhuǎn)錄的啟動(dòng)子;
(3)轉(zhuǎn)錄調(diào)控序列(轉(zhuǎn)錄終止子,核糖體結(jié)合位點(diǎn));
(4)一個(gè)多限制酶切位點(diǎn)接頭;
(5)宿主體內(nèi)自主復(fù)制的序列。
4. 原核表達(dá)一般程序
獲得目的基因-準(zhǔn)備表達(dá)載體-將目的基因插入表達(dá)載體中(測(cè)序驗(yàn)證)-轉(zhuǎn)化表達(dá)宿主菌-誘導(dǎo)靶蛋白的表達(dá)-表達(dá)蛋白的分析-擴(kuò)增、純化、進(jìn)一步檢測(cè)