表達(dá)DNA轉(zhuǎn)錄為mRNA,再翻譯為蛋白質(zhì)。不可濫用。mRNA產(chǎn)生后不一定就能翻譯為蛋白質(zhì),如卵母細(xì)胞母源信息mRNA,受精卵發(fā)育初期才表。由mRNA被一些蛋白質(zhì)結(jié)合,也可能其他原因如小分子RNA作用。
mRNA的選擇性運(yùn)輸
細(xì)胞不同情況下選擇地將不同hnRNA加工成mRNA運(yùn)至細(xì)胞質(zhì),--mRNA的選擇加工運(yùn)輸,一種通核孔的主動(dòng)運(yùn)輸方式,可能機(jī)制大:1.依賴核孔復(fù)合體上受體蛋白對(duì)RNA分子的特異性識(shí)別,缺少識(shí)別信號(hào)便保留在核內(nèi);2.不需要識(shí)別信號(hào),除被特別保留在核內(nèi)的RNA外:其余RNA自動(dòng)輸出細(xì)胞核;3.存在選擇輸出保留的聯(lián)合機(jī)制。
翻譯水平調(diào)節(jié)
主要是控制mRNA的穩(wěn)定性和mRNA翻譯起始的調(diào)控。
所謂在翻譯水平上的調(diào)節(jié),是說基因轉(zhuǎn)錄的各種mRNA并不都能翻譯成蛋白質(zhì),在不同細(xì)胞中有不同的mRNA得到翻譯,結(jié)果不同細(xì)胞具有不同的蛋白質(zhì),細(xì)胞內(nèi)才有了差別(分化),是否有這種調(diào)節(jié)機(jī)制呢?
早就注意到在海膽未受精卵中存在著較穩(wěn)定(未活化)的mRNA,這種mRNA只有在受精后才能翻譯,稱為母體mRNA(maternal mRNA)。推測這種mRNA可能在未受精卵中被蛋白質(zhì)遮蓋,或被局限在細(xì)胞內(nèi)某一特定區(qū)域而不能被翻譯。而在受精后從這類束縛中解放出來,開始翻譯成蛋白質(zhì)。所以認(rèn)為,在真核細(xì)胞對(duì)基因表達(dá)調(diào)節(jié)的一條重要途徑是產(chǎn)生穩(wěn)定性的mRNA,處于隱蔽狀態(tài),在一定條件下進(jìn)行翻譯。
除了和蛋白結(jié)合,不導(dǎo)致能翻譯為蛋白外,這里我要重點(diǎn)提出miRNA,可以對(duì)翻譯水平上進(jìn)行調(diào)節(jié),使蛋白不表達(dá)或直接降解mRNA,主要研究的熱點(diǎn)是和腫瘤抑制基因和癌基因的關(guān)系。
mRNA代表基因轉(zhuǎn)錄水平,protein代表翻譯水平,表示功能,常常還要做免疫組化,進(jìn)行組織定位和亞細(xì)胞定位,三者不能互相替換,
雖然說mRNA和蛋白水平是一個(gè)相偶聯(lián)的過程,但是兩者沒有必然的一致的趨勢,因此不一定mRNA水平升高了就一定蛋白濃度就會(huì)提高,反之亦然。mRNA水平升高代表的是啟動(dòng)子或者增強(qiáng)子的激活,也許是上游轉(zhuǎn)錄因子的激活,而蛋白水平的提高則大多數(shù)和功能增強(qiáng)相偶聯(lián)。機(jī)體是一個(gè)相互協(xié)調(diào)一致的整體,因此兩者的變化往往是相互偶聯(lián)的,因此驗(yàn)證兩者的關(guān)系對(duì)于確認(rèn)某個(gè)基因的激活是相當(dāng)有力的。
免疫組化或者免疫熒光都是反應(yīng)細(xì)胞內(nèi)某種蛋白定位或者形態(tài)學(xué)上的一個(gè)大致的變化趨勢的,并不能確切說明變化的形式,因此我認(rèn)為如果缺少形態(tài)學(xué)的證據(jù)只要在蛋白水平驗(yàn)證即可,畢竟都是反應(yīng)蛋白水平的,當(dāng)然反應(yīng)細(xì)胞內(nèi)定位的情況就另當(dāng)別論了。
細(xì)胞中蛋白水平取決于:
1.基因拷貝數(shù)和基因表達(dá)水平
2.信使RNA翻譯為蛋白質(zhì)的水平
3.蛋白質(zhì)在體內(nèi)降解的水平
基因表達(dá)有轉(zhuǎn)錄和翻譯兩個(gè)水平,但是調(diào)控就有很多水平,同一個(gè)基因可以有不同的轉(zhuǎn)錄本,而且mRNA可以有不同的剪接方式,因此一個(gè)基因可以有多個(gè)蛋白質(zhì)?;蜣D(zhuǎn)錄至mRNA其后再到蛋白質(zhì)還有幾個(gè)水平的調(diào)控,也可能mRNA不需要翻譯為蛋白,就降解了,也可能翻譯到一定水平后,獲得另外的信號(hào),而停止翻譯
從mRNA到protein是一個(gè)復(fù)雜的調(diào)控過程:這種現(xiàn)象我以前聽說過,mRNA水平轉(zhuǎn)錄增多,但有可能翻譯前降解增加,也可能沒有翻譯出功能蛋白。蛋白降低,可能降解加速(是特異性或非特異性),可能產(chǎn)生多聚體,要考慮檢測手段。最重要的是考慮你試驗(yàn)設(shè)計(jì)這個(gè)大背景,考慮出現(xiàn)這種現(xiàn)象的特定意義
真核蛋白還存在一個(gè)翻譯后加工問題。如果翻譯后加工不正確,蛋白可能被內(nèi)肽酶降解,也有可能活性降低。你可以做蛋白電泳,看蛋白的表達(dá)量是否變化.
轉(zhuǎn)錄和翻譯是兩個(gè)不同的過程,在某些特定的條件下可以脫節(jié)。但是首先要確定的確是mRNA升高,蛋白降低。請(qǐng)談?wù)勀阍诙縨RNA和蛋白表達(dá)水平時(shí)采用的方法!
機(jī)體存在生物鐘.即以24小時(shí)為周期,許多基因的表達(dá)在這段時(shí)間里存在峰值(量多)和谷值(量少).因此您研究的基因如果有周期波動(dòng),您的結(jié)果就完全可能,因?yàn)橛形墨I(xiàn)報(bào)告蛋白的表達(dá)比mRNA滯后3小時(shí)左右,因此您在現(xiàn)有的采樣點(diǎn)后3小時(shí)再采樣,可能蛋白表達(dá)量就與已有結(jié)果mRNA高一致.