1、細(xì)胞裂解液
細(xì)胞裂解液作用:
(1) 利用去污劑破壞脂質(zhì)雙分子層,破裂細(xì)胞;
(2) 溶解蛋白;
(3) 蛋白變性使其穩(wěn)定;
(4) 抑制蛋白酶活性。
細(xì)胞裂解成分一般使用的是表面活性劑,常用的有曲拉通X-100(Triton X-100)、脫氧膽(deoxycholate)、乙基苯基聚乙二醇(Nonidet P40,NP-40)、十二烷基磺酸鈉(SDS)。其中Triton X-100和NP-40為非離子型,deoxycholate和SDS為離子型。不同裂解成分的裂解強(qiáng)度不同,一般來說Triton X-100和SDS的裂解能力較強(qiáng),deoxycholate和NP-40的裂解效果較為溫和,可以根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)需求選用不同的裂解液。
2、蛋白酶抑制劑
破碎細(xì)胞提取蛋白質(zhì)的同時(shí)可釋放出蛋白酶,這些蛋白酶需要迅速的被抑制以保持蛋白質(zhì)不被降解。在蛋白質(zhì)提取過程中,需要加入蛋白酶抑制劑以防止蛋白水解。蛋白酶抑制劑(protease inhibitor)從廣義上指與蛋白酶分子活性中心上的一些基團(tuán)結(jié)合,使蛋白酶活力下降,甚至消失,但不使酶蛋白變性的物質(zhì)。各種蛋白酶對(duì)不同蛋白質(zhì)的敏感性各不相同,因此需要調(diào)整各種蛋白酶的濃度。由于蛋白酶抑制劑在液體中的溶解度極低,尤其應(yīng)注意在緩沖液中加入蛋白酶抑制劑時(shí)應(yīng)充分混勻以減少蛋白酶抑制劑的沉淀。
常用的蛋白酶抑制劑和各自作用特點(diǎn)如下:
(1) 苯甲?;酋7≒MSF):抑制絲氨酸蛋白酶(如胰凝乳蛋白酶,胰蛋白酶,凝血酶)和巰基蛋白酶(如木瓜蛋白酶);
(2) 乙二胺四乙酸(EDTA):作為螯合劑可逆抑制金屬蛋白水解酶;
(3) 胃蛋白酶抑制劑(pepstantin):抑制酸性蛋白酶如胃蛋白酶,血管緊張肽原酶,組織蛋白酶D和凝乳酶;
(4) 亮抑蛋白酶肽(leupeptin):可逆抑制絲氨酸、半胱氨酸蛋白酶和巰基蛋白酶,如木瓜蛋白酶,血漿酶和組織蛋白酶B;
(5) 胰蛋白酶抑制劑(aprotinin):競爭性可逆抑制絲氨酸蛋白酶,如血漿酶,血管舒緩素,胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶;
(6) AEBSF:一種水溶性的絲氨酸蛋白酶不可逆抑制劑,其抑制常數(shù)與PMSF和DFP的抑制常數(shù)相似,可以有效抑制胰蛋白酶(trypsin)、糜蛋白酶(chymotrypsin)、纖溶酶(plasmin)、激肽釋放酶(kallikrein)和凝血酶(thrombin)等蛋白酶,作為PMSF和DFP的替代物,AEBSF的毒性更低、水溶性和水溶液穩(wěn)定性更好。
(7) 烏苯美司(I Ubenimex,NN,也稱為bestatin):競爭性,可逆的氨基肽酶抑制劑,對(duì)精氨酰氨基肽酶(氨基肽酶B),白三烯A4水解酶(顯示環(huán)氧化物水解酶和氨基肽酶活性的鋅金屬蛋白酶),丙氨酰氨基肽酶(氨肽酶M /N),亮氨酰/胱氨酰氨基肽酶(催產(chǎn)素/血管加壓素酶)(白三烯D4水解酶)有抑制作用;
(8) N-(反式-環(huán)氧丁二酰基)-L-亮氨酸-4-胍基丁基酰胺(E64):半胱氨酸蛋白酶不可逆抑制劑;
(9) 胃酶抑素A(Pepstatin A):天冬氨酸蛋白酶可逆抑制劑。
3、磷酸酶抑制劑
細(xì)胞或組織裂解時(shí)會(huì)釋放出大量內(nèi)源性蛋白磷酸酶,以各種方式催化磷酸化蛋白的去磷酸化,從而影響后續(xù)的蛋白檢測(cè)。因此在提取物中適量添加外源性磷酸酶抑制劑,有利于在之后的Western blotting、免疫共沉淀檢測(cè)磷酸化蛋白質(zhì)和蛋白激酶活性測(cè)定等實(shí)驗(yàn)過程中抑制磷酸化蛋白的去磷酸化,維持蛋白質(zhì)的磷酸化狀態(tài)。
常見的磷酸酶有蛋白酪氨酸磷酸酶、堿性磷酸酶和酸性磷酸酶,常用的磷酸酶抑制劑如下:
(1) 氟化鈉(sodiμm fluoride):酸性磷酸酶可逆抑制劑;
(2) 焦磷酸鈉(sodiμm pyrophosphate):絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶不可逆抑制劑;
(3) β-甘油磷酸(β-glycerophosphate):絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶可逆抑制劑;
(4) 正釩酸鈉(sodiμm orthovanadate):堿性磷酸酶和酪氨酸磷酸酶可逆抑制劑:
(5) 鉬酸鈉(sodiμm molybdate):酸性磷酸酶不可逆抑制劑;
(6) 二水酒石酸鈉(sodiμm tartrate dihydrate):酸性磷酸酶可逆抑制劑;
(7) 咪唑(imidazole):堿性磷酸酶可逆抑制劑。