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遠(yuǎn)慕分享:RT-PCR的定義與檢測方法

2022-10-18 11:33 來源:上海遠(yuǎn)慕生物試劑
1.定義:是以RNA為模板,聯(lián)合逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)(reverse transcription,RT)與PCR,可用于檢測單個(gè)細(xì)胞或少數(shù)細(xì)胞中少于10個(gè)拷貝的RNA模板。

RNA擴(kuò)增包括兩個(gè)步驟: 在單引物的介導(dǎo)下和逆轉(zhuǎn)錄酶的催化下,合成RNA的互補(bǔ)cDNA;加熱后cDNA與RNA鏈解離,然后與另一引物退火,并由DNA聚合酶催化引物延伸生成雙鏈靶DNA, 最后擴(kuò)增靶DNA。
2.檢測方法

⑴一步法:

利用同一緩沖液,在同一體系中加入逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、Taq酶、4種dNTP直接進(jìn)行mRNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴(kuò)增。Taq酶不僅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反轉(zhuǎn)錄酶活性,可利用其雙重作用在同一體系中直接以mRNA為模板進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄和其后PCR擴(kuò)增,從而使mRNA的PCR步驟更為簡化。所需樣品量減少到最低限度,臨床小樣品的檢測非常有利。用一步法擴(kuò)增可檢

測出總RNA中小于1ng的低豐度mRNA.該法可用于低豐度mRNA的cDNA文庫的構(gòu)建及特異cDNA的克隆,并有可能與Taq酶的測序技術(shù)相組合,使得自動反轉(zhuǎn)錄、基因擴(kuò)增與基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的測序在單管中進(jìn)行。

⑵兩步法:

由于單管反應(yīng)時(shí)RT和PCR都不能在最佳條件下進(jìn)行并且 容易相互干擾,常只適宜用基因特異引物擴(kuò)增較短的基因,及定量PCR.兩步法則是將RT和PCR分別進(jìn)行,這樣使得兩個(gè)反應(yīng)充分發(fā)揮各自的特點(diǎn),更為靈活而且嚴(yán)謹(jǐn),適合那些GC含量、二級結(jié)構(gòu)嚴(yán)重的模板或者是未知模板,以及多個(gè)基因的RT-PCR。
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