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動物組織細胞基因組DNA提取 遠慕實驗√

2020-07-27 10:51 來源:上海遠慕生物試劑


一、實驗原理

真核生物的一切有核細胞(包括培養(yǎng)細胞)都能用來制備基因組 DNA.真核生物的DNA是以染色體的形式存在于細胞核內(nèi),因此,制備DNA的原則是既要將DNA與蛋白質(zhì)、脂類和糖類等分離,又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般過程是將分散好的組織細胞在含SDS(十二烷基硫酸鈉)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白質(zhì),再用酚和氯-仿/異戊-醇抽提分離蛋白質(zhì),得到的DNA溶液經(jīng)乙醇沉淀使DNA從溶液中析出。

蛋白酶K的重要特性是能在SDS和EDTA(乙-二胺四乙酸二鈉)存在下保持很高的活性。在勻漿后提取DNA的反應(yīng)體系中,SDS可破壞細胞膜、核膜,并使組織蛋白與DNA分離,EDTA則抑制細胞中Dnase的 活性;而蛋白酶K可將蛋白質(zhì)降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分離出來。


二、儀器及試劑

1. 儀器:

恒溫水浴鍋、臺式離心機、紫外分光光度計(GeneQuant)、移液器、玻璃勻漿器、離心管(滅菌)、吸頭(滅菌)

2. 試劑:

(1)細胞裂解緩沖液:

Tris (pH8.0) 100 mmol/L

EDTA (pH 8.0) 500 mmol/L

NaCL 20 mmol/L

SDS 10%

胰RNA酶 20ug/ml

(2) 蛋白酶K:稱取20mg蛋白酶k溶于1ml滅菌的雙蒸水中,-20℃?zhèn)溆谩?br>
(3)TE緩沖液(pH 8.0):高壓滅菌,室溫貯存。

(4)酚,氯-仿,異戊-醇(25:24:1)。

(5)異丙-醇、冷無水乙醇、70%乙醇、滅菌水。

三、操作步驟

1. 取新鮮或冰凍動物組織塊0.1g(0.5cm3),盡量剪碎。置于玻璃勻漿器中,加入1ml的細胞裂解緩沖液勻漿至不見組織塊,轉(zhuǎn)入1.5ml 離心管中,加入蛋白酶K (500ug/ml)20μl,混勻。在65℃恒溫水浴鍋中水浴30min,也可轉(zhuǎn)入37℃水浴12-24h,間歇振蕩離心管數(shù)次。于臺式離心機以12000 rpm離心5min,取上清液入另一離心管中。

2.加2倍體積異丙-醇,倒轉(zhuǎn)混勻后,可以看見絲狀物,用100μl 吸頭挑出,涼干,用200μlTE 重新溶解。(可進行PCR反應(yīng)等,需要進一步純化的按下列步驟進行。)

3.加等量的酚,氯-仿,異戊-醇(25:24:1)、振蕩混勻,離心12000 rpm,5min。

4.取上層溶液至另一管,加入等體積的氯-仿,異戊-醇(24:1),振蕩混勻,離心12000 rpm,5min。

5. 取上層溶液至另一管,加入1/2體積的7.5mol/L乙酸氨加入2倍體積的無水乙醇,混勻后室溫沉淀2min ,離心12000 rpm ,10min。

6.小心倒掉上清液,將離心管倒置于吸水紙上,將附于管壁的殘余液滴除掉。

7.用1ml 70%乙醇洗滌沉淀物1次,離心12000 rpm,5min。

8.小心倒掉上清液,將離心管倒置于吸水紙上,將附于管壁的殘余液滴除掉,室溫干燥。

9.加200ul TE重新溶解沉淀物,然后置于4℃或-20℃保存?zhèn)溆谩?br>
10.吸取適量樣品于GeneQuant上檢測濃度和純度。
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