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磷酸化抗體使用建議以及注意事項

2020-04-15 10:45 來源:上海遠慕生物試劑
WB磷酸化蛋白曝不出條帶的時候,會特別沮喪,特別希望有人指點一二??偨Y(jié)了下問題類型,不難發(fā)現(xiàn),磷酸化抗體的使用,仍是許多人關(guān)心的重點,今天我們單獨把它拎出來說一說吧。

1.確定樣本中磷酸化蛋白的表達量

①對的樣本,②正確的處理方法和③合適的陽性對照是實驗成功的第1步。①實驗前需先查閱文獻或通過預(yù)實驗檢測該樣本是否表達,若該樣本根本就不表達目的蛋白,那就不要浪費感情了吧;②若正常情況下樣本的磷酸化水平過低或不表達,可通過物理或化學方法進行一定的刺激和誘導(dǎo),刺激條件各不相同。但這并不代表刺激越多越好,充分但不過分(如磷酸化IRS1,僅需刺激5min,刺激過久會進入負反饋機制進而開始降解)的正確刺激會幫助得到zui佳實驗結(jié)果;③有合適的陽性對照至關(guān)重要,在任何實驗中,我們都應(yīng)考慮包含適當?shù)年栃院完幮詫φ?,可使您進一步確定抗體檢測到的特異性信號。

2.總蛋白和內(nèi)參對照都要做

普通的內(nèi)參如Actin、GAPDH等和總蛋白抗體的對照都要做嗎?對,都要做!普通內(nèi)參可以作為體系的對照,保證上樣量一致從而排除體系本身的影響,對于結(jié)果分析比對十分重要。同時,總蛋白抗體也必不可少,僅僅是檢測到磷酸化蛋白表達量的增加并不能說明問題,只有磷酸化蛋白與總蛋白比值增加了才能說明磷酸化水平增加,這種表述實驗結(jié)果的方法是zui客觀的,也是必需的。

3.確保完全裂解并使用新鮮樣本

相對于僅用裂解緩沖液裂解,裂解液裂解+超聲處理可確保整個細胞充分裂解并剪切染色質(zhì)DNA。建議在35%-40%的功率輸出條件下超聲3次,每次10s。由于不同儀器不同性能,請根據(jù)生產(chǎn)商的建議進行優(yōu)化。超聲處理時應(yīng)保持低溫,冰上操作。如果您沒有探頭超聲儀,用細的注射器針頭反復(fù)吹打也能起到類似的作用。在得到樣品后,請不要反復(fù)凍融,建議-80℃冰箱分裝保存。

4.小心蛋白sha手

組織或細胞裂解時會釋放出大量內(nèi)源性蛋白磷酸酶,它可以催化磷酸化蛋白的去磷酸化,導(dǎo)致不同于正常生理狀態(tài)的差異。因此,在lysis buffer中加入蛋白酶抑制劑和蛋白磷酸酶抑制劑,抑制磷酸化蛋白的去磷酸化,維護蛋白質(zhì)的磷酸化狀態(tài),非常重要。否則條帶很淺不說,結(jié)果可信度還不能保證。注意:PMSF#8553 要新鮮配置。

5.樣品低溫處理

除超聲時保持低溫,在做磷酸化蛋白的整個實驗過程中都要保證低溫環(huán)境。磷酸化蛋白在室溫條件下很容易被蛋白磷酸酶降解,即便加入磷酸酶抑制劑也很明顯。所以務(wù)必要保持!低溫!環(huán)境!

6.用5%脫脂牛奶的TBST室溫封閉1h

網(wǎng)絡(luò)上流傳的磷酸化抗體不適于用牛奶封閉的說法是沒有科學依據(jù)的。這一誤區(qū)的出現(xiàn)可能是由于實驗者使用了非實驗級奶粉引起的(國內(nèi)許多奶粉含有磷酸酶等雜質(zhì))。CST建議轉(zhuǎn)膜后迅速在TBS中洗滌膜幾秒,以便移除殘留的轉(zhuǎn)膜緩沖液,隨后使用5%脫脂牛奶(請使用實驗級的#9999)的TBST室溫封閉1h,這一封閉步驟有助于降低非特異性一抗結(jié)合并降低背景。另外應(yīng)避免膜封閉時間過長,因為這會掩蓋抗原表位,阻止抗體結(jié)合。CST建議所有抗體均應(yīng)如此。CST科學家生產(chǎn)驗證每一支上市的抗體的每一種應(yīng)用,顯然geng懂得如何讓抗體表現(xiàn)出zui佳的狀態(tài)。封閉完后,孵育一抗前zui好在TBST中洗滌5min。

7.一抗稀釋液

請務(wù)必根據(jù)產(chǎn)品說明書中推薦的稀釋液稀釋一抗,不同產(chǎn)品有不同zui佳稀釋液,采用CST推薦的一抗稀釋液并按標準protocol 操作實驗,是您實驗成功的保證。

8.4℃條件過夜孵育一抗

抗原抗體之間是一種非共價的結(jié)合,蛋白抗原在膜上靠的是物理吸附抗體,這種物理吸附在高溫下會變?nèi)?,容易脫落,因此,首先保證4℃抗體孵育條件非常重要。其次要保證抗原和抗體相互磨合孵育的時間,磷酸化蛋白只占總量的極少部分,過夜可保證充分結(jié)合進而曝出geng漂亮的條帶。哪怕不是磷酸化蛋白,CST也推薦4℃過夜孵育,讓結(jié)果呈現(xiàn)zui好的一面。

9.洗膜條件

一抗和二抗均建議用1*TBST (相對于PBST緩沖液,zui終信號會geng強)洗膜3次,每次5min。洗膜時間不宜過長或過短,過長會導(dǎo)致信號減弱(抗體從結(jié)合的位點脫落),過短則會導(dǎo)致背景深。另外,洗膜的時候,盒子要比膜稍微大一圈,保證膜充分的在洗滌液中晃動,且建議單張洗膜而非幾張一起清洗。

10.二抗室溫1h孵育

用5%牛奶的1*TBST稀釋的二抗(BSA稀釋二抗會產(chǎn)生較高背景),室溫1h孵育即可。

11.掌控好曝光或壓片時間

磷酸化蛋白檢測除了容易有雜帶外,還容易出現(xiàn)高背景。所以曝光或壓片的時候注意掌控好時間,時間太長會使得背景深,過短又會不容易曝出條帶或曝出條帶很淺,所以需要優(yōu)化出適合自己靶蛋白和實驗體系的zui佳曝光時間。

12.磷酸化和總蛋白抗體到底怎么孵育?

一般磷酸化和總蛋白的條帶位置基本是一樣的,所以如果樣品比較珍貴或有限的情況下,可以在壓完磷酸化抗體后,將膜strip后再壓總蛋白抗體,stripping的時候注意溫度盡量控制在50℃以內(nèi)。不過CST的做法是建議在樣品充足的情況下同時跑兩塊膠,比strip效果會geng好。

13.蛋白Marker很重要!

做磷酸化蛋白WB時,除了目的蛋白的條帶外,還可能會出現(xiàn)一些非特異性條帶。所以在此情況下,請一定要根據(jù)marker大小進行比對,查看條帶的分子量。否則有可能會誤以為一些非特異條帶是自己想要的,分析半天走了冤枉路不說,還耗費了大量精力。

zui重要的,是抗體質(zhì)量要好!

抗體具體使用條件,請嚴格遵照抗體說明書,這都是生產(chǎn)和驗證抗體的科學家經(jīng)過很多摸索,優(yōu)化出來的zui佳條件。
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