大腸桿菌質(zhì)粒DNA的提取步驟
2023-11-16 10:55 來源:上海遠慕生物試劑
堿裂解法:此方法適用于小量質(zhì)粒DNA的提取,提取的質(zhì)粒DNA可直接用于酶切、PCR擴增、銀染序列分析。
質(zhì)粒DNA的提取是從事基因工程工作中的一項基本實驗技術(shù),但提取方法有很多種,以下介紹一種最常用的方法:
堿裂解法:此方法適用于小量質(zhì)粒DNA的提取,提取的質(zhì)粒DNA可直接用于酶切、PCR擴增、銀染序列分析。方法如下:
1、接1%含質(zhì)粒的大腸桿菌細胞于2ml LB培養(yǎng)基。
2、37℃振蕩培養(yǎng)過夜。
3、取1.5ml菌體于Ep管,以4000rpm離心3min,棄上清液。
4、加0.lml溶液I(1%葡萄糖,50mM/L EDTA pH8.0,25mM/L Tris-HCl pH8.0)充分混合。
5、加入0.2ml溶液 II(0.2 mM/L NaOH,1% SDS),輕輕翻轉(zhuǎn)混勻,置于冰浴5 min 。
6、加入0.15m1預冷溶液III(5 mol/L KAc,pH4.8),輕輕翻轉(zhuǎn)混勻,置于冰浴5 min 。
7、以10,000rpm離心20min,取上清液于另一新Ep管
8、加入等體積的異戊醇,混勻后于0℃靜置10min。
9、再以10,000rpm離心20min,棄上清。
10、用70%乙醇0.5ml洗滌一次,抽干所有液體。
11、待沉淀干燥后,溶于0.05mlTE緩沖液中。
煮沸法
1、將1.5ml培養(yǎng)液倒入eppendorf管中,4℃下12000g離心30秒。
2、棄上清,將管倒置于衛(wèi)生紙上幾分鐘,使液體流盡。
3、將菌體沉淀懸浮于120ml STET溶液中,渦旋混勻。
4、加入10ml新配制的溶菌酶溶液(10mg/ml),渦旋振蕩3秒鐘。
5、將eppendorf管放入沸水浴中,50秒后立即取出。
6、用微量離心機4℃下12000g離心10分鐘。
7、用無菌牙簽從eppendorf管中去除細菌碎片。
8、取20ml進行電泳檢查。
注意:
1. 對大腸桿菌可從固體培養(yǎng)基上挑取單個菌落直接進行煮沸法提取質(zhì)粒DNA。
2. 煮沸法中添加溶菌酶有一定限度,濃度高時,細菌裂解效果反而不好。有時不同溶菌酶也能溶菌。
3. 提取的質(zhì)粒DNA中會含有RNA,但RNA并不干擾進一步實驗,如限制性內(nèi)切酶消化,亞克隆及連接反應等。